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品牌 | 其他品牌 | 貨號 | AC16L068 |
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供貨周期 | 現貨 | 應用領域 | 生物產業 |
《Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒》(Quick Cell qPCR Mycoplasma Detection Kit with Probe)采用支原體特異性引物和支原體特異性熒光探針(報告基因為FAM),用于對樣品的支原體基因組DNA進行熒光定量PCR擴增檢測。試劑盒內同時含有內參對照質粒mycoIC2和相應的引物和熒光探針(報告基因為VIC),用于監控支原體DNA提取和qPCR擴增的效率。本試劑盒可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:體外細胞培養的上清、血清、各種體液(如唾液、尿液、鼻腔分泌物)、別的液體樣品。
經多次測試,本試劑盒有記錄可以識別在體外細胞培養中曾經報道出現的20種支原體。根據文獻報道,這些支原體基本上占污染細胞的支原體種類的100%。具體如下:(1)M. hyorhinis、(2)M. fermentans、(3)M. arginini、(4)M. hominis、(5)M. orale、(6)M. salivarium、(7)M.pirum、(8)A. laidlawii、(9)M. agalactiae、(10)M. bovis、(11) M. bovoculi、(12)A. axanthum、(13)M. buccale、 (14) M. pneumoniae、(15)M. arthritidis、(16)M. pulmonis、(17)M. gallisepticum、(18)M. gallinarum、(19)M. canis、(20)Ureaplasma urealyticum(注:M.為Mycoplasma的縮寫;A.為Acholeplasma的縮寫)。
訂購信息
產品名稱 | 產品貨號 | 規格 | 價格 |
Quick Cell探針法支原體檢測試劑盒 | AC16L068 | 50 T | 1980 |
產品組分
產品組分 | 規格 |
探針法溶液1P(50T) | 550 μL,含支原體和內參檢測用引物及熒光探針 |
探針法溶液2T(50T) | 50 μL,酶溶液 |
內參質粒mycoIC2 | 500 μL |
去離子水 | 1.2 mL |
陽性支原體DNA | 50 μL |
【注】:①本試劑盒由于含有內參質粒mycoIC2(用于監控支原體DNA提取和qPCR擴增的有效性),客戶可以選擇進行樣品支原體DNA的提?。▋葏①|粒mycoIC2在支原體DNA提取過程中加入),也可以選擇不進行樣品支原體DNA的提?。▋葏①|粒mycoIC2直接加入樣品中)。
②本試劑盒的配套儀器可以是任何具有FAM和VIC檢測通道的熒光定量PCR儀。
運輸與保存
藍冰運輸。-20℃避光保存,有效期60個月。
使用方法
1.待測樣品的準備
為了準確判斷細胞是否有支原體的污染,待測的細胞培養液樣品需要取自換液后培養2-3 d 且匯合度在90%左右的細胞培養液上清(貼壁細胞)。懸浮培養的細胞也需要在換液傳代后,讓細胞生長2-3 d 再取培養液進行檢測??梢园凑找韵聝煞N方法之一進行樣品的前處理:
方法一:對樣品進行支原體DNA的提取
(1)很多樣品(比如:培養很多天的細胞上清、血清、血漿等)由于含有抑制PCR擴增的成分,如果樣品不進行前處理而直接檢測,有可能導致qPCR擴增失?。╭PCR結果:支原體通道和內參對照通道均無擴增曲線)。該類樣品建議客戶進行樣品DNA提?。ɑ蛘唠x心清洗,見后文方法二)后,再進行檢測。提取DNA的過程有兩個作用:①可以*去除所有可能抑制PCR擴增的成分,保證后續定量PCR擴增的正常進行;②具有濃縮支原體DNA的作用,可以提高相對檢測靈敏度10-100倍。
方法二:樣品不經DNA提取(推薦本方法,不僅可以濃縮支原體從而提高相對檢測靈敏度,還可以去除絕大部分可能的抑制物,PCR擴增被抑制的可能性極低)
(1)根據濃縮倍數,可以取100 - 1500 μL上述待測樣品到1.5 mL離心管內,在普通臺式離心機上1000 rpm (大約150 g)低速離心5 min,將離心后的上清轉移到另一個離心管內,丟棄細胞沉淀。
(2)將上清繼續13000 rpm(約16000 g)高速離心5 min,小心吸走全部上清(勿碰到沉淀?。?,用50μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8(樣品可長期保存)重懸沉淀(沉淀中含有支原體),吹吸均勻(如果最初使用了1500 μL的樣品,則支原體濃度大約提高了30倍)。
(3)往50 μL重懸后的樣品中加入4 μL內參質粒mycoIC2(內參質粒融化后,請混勻后再吸?。?。
(4)進行熱處理后再檢測,具體如下:95 ℃加熱處理5 min(可以轉移到PCR管內,在PCR儀上進行加熱處理),簡單離心(1000 g,5 s)后,取上清進行檢測。
【注】:①這里的細胞培養上清不是指細胞經胰酶消化后的離心上清,而是指至少培養2 d 后的貼壁細胞培養液上清(不需要胰酶消化,也不能取經胰酶消化后的離心上清進行檢測)或懸浮細胞培養液。
②本步驟的低速離心,需要嚴格控制在150-200 g,該離心力下哺乳動物細胞將被沉淀下來而支原體不會;否則,容易導致假陰性。
③收集的待測細胞培養液樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存;為了節約檢測成本,可以將不同時間收集的樣品放于-20℃或-80℃冰箱保存,而后一起檢測。
2.熒光定量PCR體系的配制(本步驟所有操作建議使用濾芯吸頭,以避免試劑被污染)
將探針法溶液1P、陽性支原體DNA、去離子水從-20 ℃冰箱中取出,放室溫融化(也可以用手握住幫助融化)。探針法溶液1P和探針法溶液2T開蓋之前,請高速離心一下(5000 rpm,離心1 min)。探針法溶液2T不能在室溫長久放置,建議在-20 ℃冰箱直接吸取。
如果樣品總數為N(N=待測樣品數+1個陽性對照+1個陰性對照),qPCR反應體系分為樣品經DNA提取和不經DNA提取兩個不同反應體系,具體如下:
2.1 樣品進行DNA提取后的反應體系(在DNA提取過程中,必須按說明書加入內參質粒mycoIC2):
(1)反應體系:
表1. 樣品經DNA提取后的反應體系
單個樣品體積(μL) | 樣品總數 | 總體積(μL) | |
探針法溶液1P | 11 | N | 11×N×1.1 |
探針法溶液2T | 1 | N | 1×N×1.1 |
【注】:總體積中多配制10%,為了防止移液誤差;裝有陽性支原體DNA的螺口管請不要高速離心,開蓋之前,只要用手指捏住,用力甩一下即可。吸取之前,請吹吸均勻后再吸取。如果不小心高速離心了,務必吹吸均勻后再吸取,否則陽性對照結果可能異常。
【例】:如果待測樣品為8個(加上1個陰性和1個陽性對照),則樣品總數為10個。探針法溶液1P的總體積為11×10×1.1=121 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.1=11 μL。
(2)將上述2種溶液混合,吹打均勻后,按每管12 μL分裝到熒光定量PCR八聯管中。
(3)待測樣品管加入18 μL提取好的待測樣品DNA(樣品DNA加入量不能減少,否則內參質粒擴增可能失?。?;陰性對照管加入2 μL內參質粒mycoIC2(吹吸均勻后加入)和16 μL去離子水(為防止去離子水被污染,此處建議使用20 μL移液槍配合200 μL吸頭進行吸取操作);陽性對照管加入2 μL陽性支原體DNA 和16 μL去離子水。每管反應液的總體積為30 μL。
2.2 樣品不經DNA提取的反應體系:
(1)反應體系:
表2. 樣品不經DNA提取的反應體系
單個樣品體積(μL) | 樣品總數 | 總體積(μL) | |
去離子水 | 16 | N | 16×N×1.06 |
探針法溶液1P | 11 | N | 11×N×1.06 |
探針法溶液2T | 1 | N | 1×N×1.06 |
【注】:總體積中多配制6%,為了防止移液誤差,以保證每個反應管中的反應液足量;裝有陽性支原體DNA的螺口管請不要高速離心,開蓋之前,只要用手指捏住,用力甩一下即可。吸取之前,請吹吸均勻后再吸取。如果不小心高速離心了,務必吹吸均勻后再吸取,否則陽性對照結果可能異常。
【例】:如果待測樣品為8個(加上1個陰性和1個陽性對照),則樣品總數為10個。去離子水的總體積為16×10×1.06=169.6 μL 探針法溶液1P的總體積為11×10×1.06=116.6 μL,探針法溶液2T的總體積為1×10×1.06=10.6 μL。
(2)將上述3種溶液混合,吹打均勻后,按每管28 μL分裝到熒光定量PCR八聯管中。
(3) 待測樣品管加入2 μL未提取的待測樣品DNA,陰性對照管加入2 μL內參質粒mycoIC2(吹吸均勻后加入),陽性對照管加入2 μL陽性支原體DNA。每管反應液的總體積為30 μL。
2.3 蓋上熒光定量PCR八聯管蓋子,去除反應管中的大氣泡,3000-6000 rpm離心30 sec。
3.實時熒光定量PCR擴增
將PCR八聯管放入熒光定量PCR儀內,設置如下實時熒光定量PCR擴增程序:
表3. 熒光定量PCR擴增程序
步驟 | 作用 | 循環數 | 溫度 | 時間 | 收集熒光信號 |
1 | 預變性 | 1 cycle | 95 ℃ | 30 sec | 否(No) |
2 | 預擴增 (不收集熒光) | 5 cycles | 95 ℃ | 10 sec | 否(No) |
60 ℃ | 35 sec | 否(No) | |||
3 | 正式擴增 (需要收集熒光) | 40 cycles | 95 ℃ | 10 sec | 否(No) |
60 ℃ | 35 sec | 是(Yes) |
【注】:支原體檢測熒光通道選擇FAM(Reporter: FAM,Quencher: None);內參對照檢測熒光通道選擇VIC(Reporter: VIC, Quencher: None);反應體積(Sample Volume)為30 μL;參考熒光(Passive Reference,只有ABI儀器需要設置)選擇None。
4.結果分析
4.1 ABI StepOne Plus 熒光定量PCR儀基線和閾值設定方法(其他熒光定量PCR儀的設置大同小異,請參考各自儀器說明書進行設置):
(1)基線(Baseline)的設定:可以將Auto baseline前面的√ 去掉,然后手動設置基線的起點為2(將剛開始熒光值不穩定的幾個循環排除在基線之外。如果起點2不合適,可以適當增減),終點為10左右。
(2)閾值(Threshold)線的設定:不同通道的閾值應該分別設定。設定某個通道閾值線時,首先選中含陰性對照的若干個樣品,去掉儀器勾選的自動Threshold線,將其選項“√ Auto"改為“ Auto",然后手動調整閾值線,以閾值線剛好超過正常陰性對照FAM通道擴增曲線(無規則噪音線)的最高點為準。
4.2 實驗有效性判斷:
陽性對照管:其FAM通道有典型的S型擴增曲線(即指數擴增),其VIC通道的擴增線呈直線或者S型曲線。
陰性對照管:其FAM通道的擴增線呈直線,其VIC通道應該有典型的S型擴增曲線。
如果陽性對照管、陰性對照管同時滿足上述條件,則說明本次實驗結果有效,否則實驗結果無效。
典型的陰性直線型擴增線和陽性S型擴增曲線如圖1所示:
圖1. 典型的陰性直線型擴增線(左)和陽性S型擴增曲線(右)
4.3 待測樣品結果判斷:
待測樣品有可能出現以下4種組合:
表4. 待測樣品管FAM通道和VIC通道可能組合
組合 | FAM通道(測支原體) | VIC通道(測內參) | 支原體污染判斷 |
1 | S型曲線 | S型曲線 | 支原體污染 |
2 | S型曲線 | 直線 | 支原體污染 |
3 | 直線 | S型曲線 | 無支原體 |
4 | 直線 | 直線 | PCR被抑制,結果無效 |
待測樣品管只要FAM通道有S型擴增曲線(組合1和組合2)就說明有支原體污染。因為外加的內參質粒mycoIC2分子數極少,如果支原體含量很大時,內參質粒的擴增會被*抑制,導致內參VIC通道無信號(組合2)。
如果待測樣品管FAM通道呈直線,而VIC通道有S型曲線(樣品的DNA提取過程和PCR擴增過程均正常。由于提取過程中,外加的內參質粒mycoIC2分子數極少,作為內參對照的VIC通道的Ct值會比較大),說明樣品無支原體。
如果陽性對照管和陰性對照管結果正常,而待測樣品管FAM通道和VIC通道均呈直線,說明PCR被抑制。如果樣品是經過提取的,最可能原因是:DNA洗脫前,吸附膜中的乙醇沒有揮發*(解決方法:洗脫前,將吸附柱放50-65℃烘箱至少15 min)。如果樣品是沒有經過提取的,則樣品本身含有抑制PCR的成分(解決方法:將樣品進行DNA提取或者離心清洗)。此外,二者相同的可能原因有(此種情況發生概率很低,一般不需要考慮):內參質粒mycoIC2在運輸和儲存中有部分降解,導致回收或者加入的內參質粒mycoIC2分子偏少,導致內參VIC通道擴增失?。ń鉀Q方法:將內參質粒mycoIC2的加入量增加到原來的2-4倍)。
【注】:陽性結果需要結合擴增曲線(主要)和Ct值(次要)進行判斷,不能只看Ct值(因熒光值的波動,個別陰性樣品雖然擴增曲線基本呈直線,但可能會出現Ct值,此類樣品不能判斷為陽性。反之亦然:有些樣品有S型曲線,但是因為熒光值波動,導致沒有Ct值,此類樣品不能判斷為陰性)。
注意事項
本產品主要用于細胞上清支原體污染檢測,僅限于科學實驗研究使用,不得用于臨床診斷、治療等領域
防DNA污染注意事項:
(1)強烈建議所有操作(特別是qPCR體系配制步驟和吸取試劑盒中試劑的時候)使用濾芯吸頭進行操作,以免試劑被污染。
(2)必須確保使用的移液槍本身沒有殘留的支原體。
(3)樣品前處理的各類吸頭、離心管,以及吸取陽性對照DNA、待測樣品DNA的吸頭,務必小心處理,請將其裝入含有半瓶水的帶蓋的、可密封的瓶子內,全部樣品吸取完后,蓋上瓶蓋,以防止陽性DNA的揮發,造成環境的污染,進而造成假陽性。整個操作過程,最好不要說話,因為人的口腔和唾液都是帶支原體的。
(4)反應后,請勿打開反應管的蓋子,否則有可能造成檢測環境的污染。結果判斷完后,將其用自封袋密閉后,進行適當處理。
實驗室必須嚴格分房間操作(本試劑盒建議在有窗戶、通風良好的普通房間內操作,請勿在密閉的房間操作。請勿在細胞培養間進行該步驟的操作,因為細胞培養間支原體污染概率很高):
試劑配制房間1:專門進行定量PCR體系的配制(建議該房間全部使用進口濾芯吸頭。)
DNA提取房間2:專門進行支原體DNA的提??;
DNA加樣房間3:專門進行定量PCR體系配制后,添加待測樣品、陽性對照、陰性對照等操作;
PCR擴增房間4:進行實時熒光PCR擴增檢測。
【注】:如果房間緊張,可以考慮將房間2、房間3合并在一個房間,而房間1和房間4必須獨立。各房間物品(包括移液槍)均為專用,不得交叉使用。
如果出現qPCR的擴增被細胞的代謝產物抑制時(qPCR結果:支原體通道和內參對照通道均無擴增曲線),可以采取以下幾種措施:
(1)將取樣的時間提前到換液后2 d或3 d,此時細胞上清的PCR擴增抑制物相對比較少,一般不會產生嚴重的抑制。據我們測試,換液后5 d,PCR擴增抑制物就已經大量積累。
(2)用PBS對待測樣品進行離心清洗,去除樣品中的抑制物。具體方法如下:取1 mL細胞上清,先13000 rpm離心5 min,吸走950 μL上清;加PBS 950 μL,再次離心,吸走950 μL上清;再加PBS 950 μL,第三次離心,吸走全部上清,用50 μL 5 mM Tris-HCl, pH 8.0-8.8 重懸沉淀,95 ℃加熱處理5 min,簡單離心(1000 g,5 s)后,取上清進行檢測。但是該方法有如下缺點:第一,如果樣品支原體含量較少,離心清洗可能導致漏檢,因為離心清洗過程中,可能導致支原體部分丟失。第二,個別樣品,即使經過上述清洗也無法*去除抑制劑。
(3)抽提細胞上清的支原體DNA后再進行PCR鑒定。
(4)使用李記生物的《Quick Cell支原體快速檢測試劑盒(細胞培養專用)》(貨號:AC16L061)或者《Quick Cell 發光法支原體檢測試劑盒》(貨號:AC16L062)進行檢測,經測試,未發現這兩種試劑盒會被細胞的代謝產物所抑制。為了預防PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制的問題,也可以考慮將所有待測樣品全部進行離心清洗或者DNA提取后,再使用本試劑盒進行檢測。
支原體檢測樣品可以分成兩類:第一類,用含血清的培養液培養的哺乳動物細胞上清液,由于該條件非常適合支原體生長,培養數天后,支原體密度一般較高,可達107-9/mL,可以直接檢測。第二類,低溫保存的血漿、血清、臍帶血、胰酶、抗生素、未使用的培養液等樣品,由于這些樣品即使有支原體污染,支原體含量一般很少,直接使用快速支原體檢測試劑盒進行檢測,往往檢測不出來。這些樣品建議:(1)對樣品的支原體進行離心濃縮將支原體DNA濃縮提取,該兩種方法大約可以將檢測靈敏度繼續提高10-100倍。該方法速度快,當天出結果,但是可靠性不如后面的培養法。(2)使用支原體液體培養基(必須同時接種不含精氨酸和含精氨酸的兩種支原體液體培養基)培養3-7 d后,再進行檢測。具體方法請參考李記生物《Quick Cell 發光法支原體檢測試劑盒》(貨號:AC16L062)說明書中最后的注意事項部分。該方法速度較慢,需要3-7 d,但是可靠性高。
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